五年制口腔医学专业设有课程共计94门，包括校必修课22门、院必修课34门、专业必修课18门、专业选修课20门。

院必修课包括口腔医学导论、人体解剖学、人体解剖学实验、组织胚胎学、组织胚胎学实验、生理学、生理实验、生物化学、生物化学实验、医学免疫学、医学免疫学实验、病原生物学、病原生物学实验、病理学、病理学实验、病理生理学、病理生理学实验、药理学、药理学实验、实验诊断学及实习、临床诊断学及实习、医学影像诊断学及实习、内科学、外科学、儿科学、预防医学、医学心理学、医学统计学等。

专业必修课包括口腔解剖生理学、口腔组织病理学、口腔微生物学、口腔药物学、口腔专业英语、口腔材料学、口腔颌面影像诊断学、口腔设备学及维修、口腔内科学及实习、口腔颌面外科学及实习、儿童口腔医学及实习、口腔预防保健学、口腔修复学及实习、口腔正畸学及实习等。

专业选修课包括耳鼻喉科学、眼科学、医学伦理学、循证医学、卫生政策与法规、科研方法论、社会保障学、医用高分子材料、生物材料、传染病学、牙合学、口腔医学史、口腔老年病学、颞颌关节病学、口腔种植学、口腔护理学、口腔医学进展专题讲座与综述等。